Als die 1851 gegründete Bonifatiuskapelle am Blobach für die wachsende katholische Gemeinde Mühlhausens zu klein wurde, plante man 1884 den Bau einer neuen Kirche. Nach der Grundsteinlegung am 14. Juli 1903 war die neogotische Kirche bereits 1905 vollendet. Die feierliche Konsekration fand am 5. August 1907 statt. Mit St. Josef wurden auch Pfarrhaus und Kaplanei errichtet. Das Liborius-Wagner-Haus vervollständigte 1995 das Bauensemble.