Der Vorläuferbau wurde am 25.05.1762 durch einen großen Stadtbrand zerstört. Wegen der allgemeinen Notlage gelang der Wiederaufbau nur unter großen Schwierigkeiten. Die neue Kirche wurde am 27.11.1774 eingeweiht. Vorbildgebend war Weidners Hauptwerk, die 1754-1760 erbaute Ohrdrufer Michaeliskirche, welche aber 1808 vollständig abbrannte. Daher zählt die Zellaer Blasiuskirche mit ihrem querovalen Grundriss, dem abgewalmten Satteldach sowie dem mittig an der Nordwand vorspringenden Turm zu den bedeutendsten kirchlichen Zentralbauten in Thüringen. Der Innenraum mit zweigeschossigen umlaufenden Emporen, einem Kanzelaltar auf der südlichen Längsseite und der ihm gegenüber liegenden Ratsloge überrascht durch seine amphitheatralische Wirkung. Die Orgel von 1778/79 gilt als eines der historisch wertvollsten Instrumente des Spätbarocks in der Thüringer Orgellandschaft. Ihr Schöpfer Johann Caspar Rommel aus Roßdorf/Rhön (1721-1800) war einer der bedeutendsten Orgelbauer seiner Zeit.