Die Martinskirche ist die älteste Kirche in Apolda. Sie wurde bereits im Jahr 1119 erstmals urkundlich erwähnt, im selben Jahr wie Apolda selbst. Ursprünglich lag die Kirche außerhalb der Stadtmauern nahe dem Zusammenfluss von Herressener und Schötener Bach.

Die Martinskirche ist eine evangelische Kirche, verlor mit der Weihe der Lutherkirche im Jahr 1894 an Bedeutung. 1925/26 erfolgte der letzte größere Umbau, bei dem das Langschiff vom Chorraum abgetrennt wurde.

Für die Gottesdienste, die hier noch regelmäßig stattfinden, wird nur noch der vordere Teil der Kirche, die Martinskapelle, genutzt. Die Martinskapelle gehört auch heute noch zur evangelisch-lutherischen Kirchgemeinde.