Windeberg ist ein Ortsteil von Mühlhausen und liegt nördlich von Mühlhausen, am Rand des Thüringer Becken. Die urkundliche Ersterwähnung erfolgte 1296. Seit 1992 ist Windeberg ein Ortsteil von Mühlhausen.  

Sehenswert sind die Kirche St. Nikolaus sowie eine alte Holländermühle am westlichen Ortsrand. Die Kirche wurde im 16. Jahrhundert erbaut und die Mühle im Jahr 1860. Östlich grenzt Windeberg an das Naturschutzgebiet Flachstal an. Nördlich und südlich von Windeberg schließen sich Waldgebiete an.

Ein Maifeuer und die Kirmes sind jährlich, kulturelle Höhepunkte des Dorflebens.